武警部队确认实验室成立于1996年，业务关系立属于国家疾病控制中心性病艾滋病中心参比实验室管理，担负武警部队和武警总医院门诊及住院患者艾滋病确认，流行病学调查，国家有关性病艾滋病政策的解读与宣讲，对性病艾滋病感染者，发病者的心理疏导，以及感染者自身免疫水平的监测及评估等。